台湾海洋大学前身为台湾省立海事专科学校，创立于1953年，当时校地仅有二百坪，在人力、物力均不足的情形下，经历任院长、校长及全体师生不畏艰困，任劳任怨的努力下，克服万难，使得学校逐步成长，于民国1964年改制为台湾省立海洋学院，1979年改制为“国立”台湾海洋学院，1989年改名为“国立”台湾海洋大学。

目前本校设有海运、生命与资源科学、工、理及技术等五个学 院，下设十四个学系其中十三个学系设有硕士班；八个学系设有博士班及八个独立研究所，皆设有硕士班；其中有六所拥有博士班。现有专任教师三百余人，其中 80％以上具有博士学位。本校为提升教学及研究水准，除陆续延揽优秀师资来校任教外，并依据本校总体发展目标，在教学方面，加强通识教育与专业训练之配合，设计具系统性的基础性学程，与特色性专门学程；在学术研究方面，则致力于研究所素质的提升，积极推动跨院所系之大型研究计划，并促进国际学术交流与合作。而行政方面相关措施亦配合推动，以充分支持学术与研究需要。在整体发展的规划下，未来本校除将继续发展海运、生命与资源科学、工及理四个学院外，亦将强化海事水产高等技职教育体系。海运学院方面，将加强通讯、操船、船机、自动控制、导航、货载管理、法商管理等之教学与研究。生命与资源科学学院方面，在教学上，以传授基础生命科学、生物技术、食品科技以及海洋资源保育、管理经济知识；在研究上，利用生物化学、分子生物学与传统生物学之方法，以动物、植物及微生物为材料进行生理、遗传、型态、分类、生态研究以及生物技术之应用研发、资源之开发、利用与管理之研究领域。工学院方面，将配合海运、生命与资源科学、理学院相关学术之发展，推动海洋遥测、水中声学、海下技术、河海工程、造船工程、螺桨空蚀、材料工程等之海洋科技的教学与研究。理学院方面，重视基础理学教学与研究，并着重海洋物理与波浪、海洋生物与化学、海洋地质、海洋变迁、板块运动、断层监测、古气候/古海洋、地理信息系统等方面之研究，另积极扩展光电、信息、奈米领域之研究。

至于有关技职体系之强化，将结合海运、生命与资源科学院及工、理等学院之系所，提供可为海事水产技职学生之进修管道。此外，并将扩展人文社会学院，使海洋大学能均衡发展，成为一所以海洋专业、科技与人文三者并重的综合大学。拥抱海洋、心怀蓝天、放眼天下，海洋大学将以更积极、更多元化、更有弹性与更活泼的办学态度，迎接21世纪。