马英九就任“总统”一周后，立刻对军中扁系将领人事开铡，后备司令部五个月后才降编，马英九是提前摘除扁系将领龙头后备司令余连发上将指挥职。余连发是陈水扁第一任侍卫长，扁第一位晋用的将领，八年来许多将领靠余推荐升官，余下台后，扁系将领人人自危。

　　联合晚报报道，余连发任后备司令三年，是目前各军种司令任期最久的一位，显示陈水扁力挺。陈水扁任内八年，许多军队将领人事案都有余连发影子，有位扁系将领原本以为升迁无望，先是申请任大学教官，后来找上余连发却有机会升官，两件人事案摆在当时“国防部长”李杰面前，李杰不买帐，这位将领只好去当教官。

　　余连发“宪兵司令”任内，积极为陈水扁拉拢“宪兵”与“后备宪兵”情谊，让过去对民进党素无好感的“宪兵”，变成最挺扁的部队，导致后来闹出巧克力事件。

　　余连发是扁系将领最高阶的一位，后备司令部今年11月降编，马英九未循往例让余留任到降编，提前摘除余的指挥职，“国防部长”陈肇敏也宣示严禁军中逢迎谗陷风气，显示军中开始清除挺扁残余势力，余去职，许多靠扁提拔的将领无不人人自危。

　　何壅坚找同乡老萧拉关系

　　宪兵司令何壅坚与余连发类似，都是侍卫长出身挺扁将领，挺扁不遗余力。2004年连宋与扁吕竞争激烈，据指出，何当时告诉同僚，扁连任，两岸可能打仗，但他会升官。马胜选后，何又托人找嘉义同乡副“总统”萧万长拉关系，也托人向马表态，希望能留任一年。何壅坚这两天正在邀约“宪兵”退伍的电视政论名嘴喝咖啡，争取舆论支持。

　　“国防部”军法司司长吴泰然也是知名扁系将领，陈水扁儿子陈致中在海总服预官役，吴泰然是陈致中直属长官，军方安排吴泰然一路晋升少将、中将，今年“总统”大选前军方爆发鐽震弊案，吴泰然极力协助控制军中外泄弊案情节，发动军事检察官约谈报导鐽震弊案媒体记者。军法司长是军法官科最高职位。

　　彭胜竹低调可望做完任期

　　“空军司令”彭胜竹是另一位侍卫长出身扁系将领，但因为行事沉稳低调，不好出风头，不惹争议，加上“部长”也是空军将领退伍，对彭不会下重手，彭应可顺利做完两年任期后卸任。